Częstym problemem w izolowanych systemach wodnych, takich jak akwaria i stawy, jest usuwanie substancji toksycznych dla ryb, takich jak amon i azotyn, a także amoniaku przy wysokich wartościach pH. Problem ten pojawia się nie tylko przy nowych instalacjach, ale także przy dużych podmianach wody, czyszczeniu filtrów, po zastosowaniu leków, czy też gdy obumierają duże ilości organizmów organicznych np. koralowca.

Również przy przeludnieniu, przekarmieniu, przeciążeniu filtrów oraz w stawach z powodu zbyt wysokiej temperatury wody i po przerwie zimowej. Dlatego Baktoplan należy stosować we wszystkich takich sytuacjach, aby stworzyć równowagę biologiczną.

Szczepy Nitrosomonas i Nitrobacter zapewniają szybką i bezpieczną konwersję amonu/amoniaku w azotan, który jest nietoksyczny dla ryb. Harmonizacja poszczególnych procesów metabolicznych, przy prawidłowym i regularnym dodawaniu, powoduje, że azotyn jako produkt pośredni z reguły nie jest mierzalny w wodzie.